Головна Головна -> Реферати українською -> Дисертації та автореферати -> реферат безкоштовно: МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНА ДИФЕРЕНЦІАЦІЯ МІКОБАКТЕРІЙ, ВИДІЛЕНИХ В УКРАЇНІ, ТА ЇХ ФІЛОГЕНЕТИЧНІ ВЗАЄМОЗВ’ЯЗКИ

Загрузка...

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНА ДИФЕРЕНЦІАЦІЯ МІКОБАКТЕРІЙ, ВИДІЛЕНИХ В УКРАЇНІ, ТА ЇХ ФІЛОГЕНЕТИЧНІ ВЗАЄМОЗВ’ЯЗКИ / сторінка 6

Назва:
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНА ДИФЕРЕНЦІАЦІЯ МІКОБАКТЕРІЙ, ВИДІЛЕНИХ В УКРАЇНІ, ТА ЇХ ФІЛОГЕНЕТИЧНІ ВЗАЄМОЗВ’ЯЗКИ
Тип:
Реферат
Мова:
Українська
Розмiр:
20,59 KB
Завантажень:
279
Оцінка:
 
поточна оцінка 5.0
Загрузка...
Скачати цю роботу безкоштовно
Пролистати роботу: 1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11  12  13 
bovіs | BOVIS 1 | Київська
1505 | 200003774075600 | M. caprae | CAP | Харківська
1544 | 200003777377600 | M. caprae | CAP | Херсонська
1545 | 200003777377600 | M. caprae | CAP | Херсонська
1523 | 406323476514600 | M. bovіs | BOVIS 2 | Київська
1527 | 406323476514600 | M. bovіs | BOVIS 2 | Київська
1546 | 406323476514600 | M. bovіs | BOVIS 2 | Київська
1547 | 406323476514600 | M. bovіs | BOVIS 2 | Київська
1548 | 406323476514600 | M. bovіs | BOVIS 2 | Київська
1511 | 476763636776600 | M. bovіs | унікальний | Луганська
1539 | 406323476510200 | M. bovіs | унікальний | Чернігівська
Дослідження атипових мікобактерій за допомогою гель-електрофорезу в пульсуючому полі. Усі 23 досліджувані штами мали унікальні фінгерпринтинги. Поліморфізм патернів рестрикції продемонстрував високий ступінь гетерогенності штамів M.. Усі штами M. fortuitum, що мали профіль рестрикції з 17 смужок, були виділені в Чернігівській області, окрім одного з Харківської. Штами M. fortuitum, профіль рестрикції яких складався із 21–23 смужок, походили з Одеської області, за винятком одного штаму з Чернігівської області. Результати, отримані за допомогою ГЕПП, свідчать про можливість встановлення ступеня спорідненості двох або більше ізолятів мікобактерій одного виду між собою.
Видова диференціація мікобактерій за допомогою секвенування ділянки гена 16S рибосомальної РНК. За допомогою цього методу вперше вдалось отримати дані про циркуляцію на території України таких видів мікобактерій, як M.е, M.M. M., M.M.M. За результатами наших досліджень найчастіше на території України, з числа вивчених ізолятів, зустрічались комплекс M. і M. fortuitum, на долю яких припадає більше двох третин усіх ізолятів. Значно меншою є доля M. і M.. Інші види атипових мікобактерій представлені поодинокими ізолятами, їх доля не перевищує 2 % від їх загальної кількості (рис. 2).
Видовий склад мікобактерій, ізольованих з органів ВРХ, наведено на рис. 3. Як свідчать дані цього рисунка, поряд із представниками комплексу M. tuberculosis (M. і M.), на долю яких припадало 16,6 %, від ВРХ найчастіше виділялися такі види атипових мікобактерій: M. – 26,7 % (причому кількість ізолятів M. avium subsp. hominissuis майже в 2,5 рази перевищувала кількість ізолятів M. subsp. avium); M. fortuitum – 14,4 %; M. – 7,8 %; M. phlei – 6,7 %. Значною (27,8 %) була і питома вага інших 9 видів атипових мікобактерій, виділення яких від ВРХ, однак, було поодинокими випадками.
Рис. 2 Співвідношення видів атипових мікобактерій, циркулюючих в Україні (n = 109).
Рис. 3 Співвідношення видів мікобактерій, ізольованих від ВРХ (n = 83).
Результати множинного вирівнювання секвенованих ділянок 16S рибосомальної ДНК і філогенетичний аналіз. За результатами аналізу топографії побудованого філогенетичного древа визначено наявність 3 кластерів: швидкозростаючих мікобактерій, “термотолерантних” швидкозростаючих мікобактерій та повільнозростаючих мікобактерій (рис. 4). Аналіз генетичної спорідненості мікобактерій дозволив їх поділити на дві групи: швидкозростаючі і повільнозростаючі, що відповідає традиційному розподілу мікобактерій. Виключенням є штам M. doricum, який, незважаючи на дуже повільний ріст (42 доби), знайшов своє розташування в групі швидкозростаючих “термотолерантних” мікобактерій, що можна пояснити подовженням петлі 10 вторинної структури 16S рДНК завдяки однонуклеотидній інсерції, що споріднює “термотолерантні” мікобактерії.
 
Рис. 4 Філогенетичні взаємозв’язки мікобактерій. Кореневе древо побудоване на підставі аналізу первинної структури гіперваріабельної ділянки А гена 16S рибосомальної РНК.
Примітки: 1) Масштабна лінійка показує частку нуклеотидних замін; 2) Ромбом відзначено вузол галуження “термотолерантних” швидкозростаючих мікобактерій.
Результати філогенетичного аналізу не підтверджують класифікацію мікобактерій за Раньйоном. Мікобактерії були поєднані в клади відповідно до швидкості їхнього росту, що підтверджує генетичну детермінацію цієї ознаки.
Загрузка...

Завантажити цю роботу безкоштовно
Загрузка...
Пролистати роботу: 1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11  12  13 
Реферат на тему: МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНА ДИФЕРЕНЦІАЦІЯ МІКОБАКТЕРІЙ, ВИДІЛЕНИХ В УКРАЇНІ, ТА ЇХ ФІЛОГЕНЕТИЧНІ ВЗАЄМОЗВ’ЯЗКИ

BR.com.ua © 1999-2018 | Реклама на сайті | Умови використання | Зворотній зв'язок